隨著北京大運河博物館開館，運河風物、運河書屋、碼頭小敘、運河食舫和運河小鋪五大文創空間開門迎客。目前，該館依托館藏資源開發了500余種文創產品，觀眾可以親自動手喚醒“文物”，把運河禮物帶回家。
北京大運河博物館展陳大樓一層，走進“運河風物”文創中心，圍繞館藏文物、大運河文化及傳統文化，該館推出了龍生九子、大運河舟楫、古建筑系列等八大類500余種文創產品。在互動區域，觀眾可以通過打卡互動的方式，了解運河文化歷史，體驗榫卯、書法、紙扇、燈籠等豐富的傳統技藝。
北京大運河博物館主題郵局是文創中心里的一方獨立主題空間，設有一臺古法凸版印刷機。觀眾可以借用凸版印刷機，親自動手制作一張古法手工凸版印刷郵政明信片，現場寄出這份帶著歷史溫度的禮物。北京大運河博物館開館紀念封是中國郵政專為該館開館紀念定制的郵政產品，紀念封正面主圖采用黑白素描的博物館建筑外觀鳥瞰圖，主圖右下側配紅色“北京大運河博物館”篆刻印章。紀念封所貼郵票主圖為中國結，附圖采用彩色手繪版博物館建筑外觀鳥瞰圖，與主圖交相輝映。郵票上蓋有“北京通州 張家灣”郵政收寄日戳，以郵政獨有的元素將博物館所處的地理位置和開館日期銘記，具有收藏價值和紀念意義。
文創中心內還設置了互動紀念章刻字機，觀眾可以親手制作一枚專屬定制款紀念章。紀念章正面以北京大運河博物館建筑外觀、大運河舟楫、館藏文物“銅坐龍”、京杭大運河保護與申遺紀念標等圖案為原型，觀眾可以選擇自己喜歡的一款，在紀念章背面進行二次創作。
在北京大運河博物館，觀眾還可以品嘗到一系列可以吃的文創。碼頭小敘和運河食舫提供正餐、中西簡餐等各類運河主題餐食。其中，文創雪糕以大運河上的船楫和燃燈塔為創意元素，慕斯蛋糕以中華傳統文化龍生九子為原型進行二次創作，還有中式運河茶飲、運河創意茶點、運河糖葫蘆等，好看又好吃的文創，讓文物“活”起來，邀請觀眾品嘗打卡。博物館還專為飲品設計了運河沿途風物咖啡杯，請插畫師把運河地圖和沿線著名地標以彩繪的形式呈現在紙杯上，杯身展開就是大運河沿線彩繪地圖。